Arabinoos on viie süsinikusisaldusega suhkur, mida leidub looduses laialdaselt ja võib olla ainsa süsinikuallikana paljudes bakterites. Kolme geeni (araB, araA ja araD) valguproduktid on vajalikud arabinoosi lagundamiseks Enterobacteriaceae perekonna liikmetes, nagu E. coli ja S.
Mida teeb arabinoos bakteritega?
Seega, kui arabinoos on arabinoosi operoni sisselülitamiseks olemas, toodetakse GFP-d ja bakterid võivad fluorestseeruda. Ilma arabinoosita ei ekspresseeru GFP geen ja puudub fluorestsents. Seega saab teadlane toitainete koostist muutes kontrollida, millal (ja kas) transformeeritud bakterites florestsents toimub.
Mis roll on arabinoosil bakterite muundamisel?
Arabinoos toimib AraC allosteerilise regulaatorina, muutes seda, milliste DNA saitidega see seondub ja kuidas see dimeeri moodustab. Pidage meeles, et arabinoos on suhkur, mida kataboliseerivad AraBAD operoni valgud. Kui arabinoos lisatakse keskkonda, kus elab E. coli, seostub see tihed alt AraC-ga.
Miks kasutatakse arabinoosi?
Kasutamine bioloogias
Sünteetilises bioloogias kasutatakse arabinoosi sageli ühesuunalise või pöörduva lülitina valkude ekspressiooniks Pbad all.promootor E. coli-s. Selle sisselülitamise saab tühistada glükoosi olemasoluga või välja lülitada glükoosi lisamisega söötmesse, mis on kataboliidi repressiooni vorm.
Kuidaskas arabinoos mõjutab geeniregulatsiooni ja ekspressiooni bakterites?
Kui arabinoos on olemas, lõdvestab araC DNA konfiguratsiooni nii, et võib toimuda transkriptsioon, kuid kui see süsivesik puudub, piirab sama valk DNA-d, et vähendada selle seondumisvõimet RNA polümeraasiga.
