Kuna DdNTP-del on desoksüriboosi 3'-C külge kinnitatud hüdroksüülrühma (-OH) asemel vesiniku molekul (-H), ei saa see seonduda ühegi sissetuleva nukleotiidiga. Seetõttu saab sünteesireaktsiooni lõpetamiseks kasutada DdNTP-de lisamist DNA replikatsiooni ajal.
Miks DNA süntees peatub, kui ddNTP liidetakse kasvavasse DNA ahelasse?
Kui lisatud nukleotiid on "dideoksünukleotiid" (joonis 6.29), on kasvava ahela 3' otsas nüüd OH asemel H. See hoiab ära täiendavate nukleotiidide lisamise; st in vitro DNA süntees peatub sellel hetkel.
Kuidas ddNTP lõpetab DNA sünteesi?
Kui ddNTP liidetakse nukleotiidide ahelasse, süntees lõpeb. Põhjus on selles, et ddNTP molekulil puudub 3'-hüdroksüülrühm, mis on vajalik ahela järgmise nukleotiidiga sideme moodustamiseks.
Miks DdNTP-d replikatsiooniprotsessi lõpetavad?
Ensümoloogia laboratoorsed meetodid: DNA
Dideoksünukleotiid trifosfaadid liidetakse kergesti kasvavasse DNA ahelasse, kuid neil puudub 3' hüdroksüülrühm, mis on vajalik ahela jätkumiseksja lõpetab tõhus alt polümerisatsiooni.
Miks põhjustavad dideoksünukleotiidid DNA replikatsiooni seiskumise?
Neil ddNTP-del puudub 3'-OH rühm, mis on vajalik fosfodiestersideme moodustamiseks kahe vahelnukleotiidid, mistõttu DNA ahela pikendamine peatub ddNTP lisamisel.