DNA-ga kasutatakse agaroosigeele, kuna biomolekulid on suuremad (DNA fragmendid on sageli tuhanded kDa). Valgugeelide puhul annab polüakrüülamiid hea eraldusvõime, kuna palju väiksem suurus (tüüpiline on 50 kDa) sobib paremini geeli tihedamate molekulidevaheliste tühimike jaoks.
Mis vahe on agaroosgeelelektroforeesil ja polüakrüülamiidgeelelektroforeesil?
Peamine erinevus agaroosi ja polüakrüülamiidi vahel seisneb selles, et agaroosi kasutatakse agaroosigeeli elektroforeesis (AGE) peamiselt DNA eraldamiseks, samas kui polüakrüülamiidi kasutatakse polüakrüülamiidi geelis elektroforees (PAGE) peamiselt valkude eraldamiseks.
Miks on polüakrüülamiidgeelid paremad kui agaroosgeel?
Polüakrüülamiidgeelidel on agaroosgeelide ees kolm peamist eelist: (1) Nende lahutusvõime on nii suur, et nad suudavad eraldada DNA molekule, mille pikkused erinevad vaid 0,1% (st 1 aluspaar 1000 aluspaari kohta).). (2) Need mahutavad palju suuremaid DNA koguseid kui agaroosgeelid.
Miks kasutatakse valkude iseloomustamisel agaroosi asemel polüakrüülamiidi?
Polüakrüülamiid ja agaroos on kaks elektroforeesis tavaliselt kasutatavat tugimaatriksit. … Agaroosil on suured poorid ja see sobib nukleiinhapete ja suurte valgukomplekside eraldamiseks. Polüakrüülamiidil on väiksemad poorid ja see sobib ideaalselteraldab enamuse valke ja väiksemaid nukleiinhappeid.
Miks kasutatakse polüakrüülamiidgeeli?
Polüakrüülamiidgeelelektroforeesi (PAGE) kasutatakse rutiinselt valguanalüüsiks ja seda saab kasutada ka väiksemate kui 100 aluspaari suuruste nukleiinhappefragmentide eraldamiseks. Nukleiinhappeid analüüsitakse tavaliselt pideva puhversüsteemi abil, kus kogu geelis on püsiv puhvri koostis, pH ja pooride suurus.
