Peptiidsidemed on tasapinnalise, trans-konfiguratsiooniga ja läbivad väga vähe pöörlemist või keerduvad ümber amiidsideme, mis seob ühe aminohappe α-aminolämmastiku karbonüülsüsinikuga järgmisest (joonis 4-1).
Miks on peptiidsideme ümber pöörlemine keelatud?
Miks on peptiidsideme ümber pöörlemine keelatud ja millised on pöörlemise puudumise tagajärjed? Peptiidsidemel on osaline kaksikside, mis takistab pöörlemist. See pöörlemise puudumine piirab peptiidi karkassi konformatsioone ja piirab võimalikke struktuure.
Kas peptiidsidemed võivad painduda?
Kuna peptiidsidemetega koos hoitud polüpeptiidi selgroog on paindlik ("kõikide sidemete ümber pöörlemise" tõttu), võib kett painduda, väänduda, ja painduge väga paljudeks kolmemõõtmelisteks kujunditeks.
Kas peptiidsidemed on pöörduvad?
Kuigi peptiidsideme moodustumise saab tagasi pöörata vee lisamisega (hüdrolüüs), on amiidsidemed neutraalse pH juures vees väga stabiilsed ja peptiidsidemete hüdrolüüs rakkudes on ka ensümaatiliselt kontrollitud.
Kas peptiidsidemetel on suund?
Kuigi peptiidrühma geomeetria on fikseeritud, võivad alfa-süsiniku mõlemal küljel olevad sidemed pöörata. See võimaldab peptiidi selgrool paindlikkust. … Aminohapete järjestustel valgus on suund võiorientatsioon, mis on määratletud ahela otstes olevate funktsionaalrühmadega.
