Proliini leidub sageli α spiraali lõpus või pööretena või tsüklitena. Erinev alt teistest aminohapetest, mis esinevad polüpeptiidides peaaegu eranditult transformatsioonina, võib proliin peptiidides esineda cis-konfiguratsioonis.
Kas alfaheeliksid sisaldavad proliinijääke?
Nüüd, kui valgu andmepangas on üle 30 000 valgustruktuuri, on selge, et proliinijäägid esinevad α-heeliteks, kus neil on sageli oluline roll valgu struktuuris ja funktsioonis.
Millised aminohapped on alfa-heeliksides?
A-heeliksis võivad osaleda kõik 20 aminohappest, kuid mõned on eelistatumad kui teised. Ala, Glu, Leu ja Met leidub kõige sagedamini spiraalides, samas kui Gly, Tyr, Ser ja Pro on harvemini nähtavad.
Kas beetalehed sisaldavad proliini?
Proliini ei eelistata beetalehtede struktuurides, kuna see ei suuda H-sidumise võrku lõpule viia. Kui proliini esineb lehtedena, võib see olla mõhnas või lehe servas, kus amino-vesiniksideme puudumine ei ole kriitiline.
Mis sisaldab alfahelikse?
Alfaheeliks (α-heeliks) on tavaline motiiv valkude sekundaarstruktuuris ja on parema käe spiraali konformatsioon, milles iga karkass N-H rühmitab vesinikku sidemed selgrooga C=O. aminohapete rühm, mis paikneb valgujärjestuses neli jääki varem.
