Molekulaarbioloogias on STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) bioloogiline andmebaas ja veebiressurss teadaolevate ja prognoositavate valkude ja valgu interaktsioonide kohta. … Viimane versioon 11b sisaldab teavet umbes 24,5 miljoni valgu kohta enam kui 5000 organismist.
Mis on andmebaasi STRING eesmärk?
STRING
Mis on STRING skoor?
Programmis STRING on iga valgu-valgu interaktsiooni juures üks või mitu skoori. Oluline on see, et need hinded ei näita interaktsiooni tugevust ega spetsiifilisust. Selle asemel on need kindlustunde indikaatorid, st kui tõenäoline, et STRING hindab interaktsiooni tõeseks, arvestades olemasolevaid tõendeid.
Miks valgud interakteeruvad?
Valk-valk interaktsioonid (PPI-d) on suure spetsiifilisusega füüsikalised kontaktid, mis on loodud kahe või enama valgumolekuli vahel biokeemiliste sündmuste tulemusena, mida juhivad koostoimed, mis hõlmavad elektrostaatilisi jõude, vesinikku. sidumine ja hüdrofoobne efekt.
Mis on funktsionaalne seos?
definitsioon. Bioloogiliste üksuste vaheline binaarsuhe kui üks neist moduleerib teist funktsiooni, väljenduse, lagunemise või stabiilsuse ja suhte mõttespartneritevahelisi suhteid ei saa otsesena kindlaks teha, seega on vaheetapid kaudselt olemas.
