Kust leitakse DNaasi I ülitundlikkuse kohad ja mida need näitavad kromatiini olemuse kohta? Need kohad asuvad eksoni-introni ristmikel ja näitavad mRNA lõhustamiskohta splaissimise ajal. Neid kohti leidub kogu genoomis juhuslikult ja see muudab DNA lagunemise suhtes haavatavaks.
Mis on DNaasi I ülitundlik sait ja kuidas see kromatiini mõjutab?
Geneetikas on DNaas I ülitundlikud saidid (DHS) kromatiini piirkonnad, mis on tundlikud ensüümi DNaas I poolt lõhustamise suhtes. Nendes spetsiifilistes genoomi piirkondades on kromatiin kaotanud oma kondenseerunud struktuuri, paljastades DNA ja muutes selle kättesaadavaks.
Millele viitab DNaasi ülitundlik sait?
Aktiivsed cis-regulatoorsed elemendid on ülitundlikud endonukleaas DNaas I poolt lõhustamise suhtes. Motiivid DNaas I ülitundlikes saitides näitavad potentsiaalset trans-toimiva faktori hõivatust ja kombineerituna DNaas I-ga lõikeandmeid saab kasutada ajutiste reguleerivate võrkude ehitamiseks.
Mis on DNaasi ülitundlikkuse test?
Rohkem kui kaks aastakümmet on DNaas I ülitundlikkuse test (DHA) olnud regulatiivsete domeenide avastamisel abivahend (11). See meetod kaardistab genoomis diskreetsed kohad, kus kromatiini konformatsioon muudab selle DNA ülitundlikuks endonukleaasi DNaas I (12) poolt lõhustamise suhtes.
Mis on kromatiini nukleaasi ülitundlik koht?
Sissekromatiini puhul arvatakse, et nukleosoomivabad piirkonnad, mida tuntakse nukleaasi ülitundlike saitidena, esindavad "avatud aknaid", mis võimaldavad oluliste cis-toimivate DNA järjestuste paremat juurdepääsu trans-toimivatele teguritele (vt viiteid.
