Seevastu enamik eukarüootseid DNA ligaase koos arheaalsete ja bakteriofaagide ensüümidega kuuluvad teise alamperekonda; need ensüümid kasutavad ATP-d kofaktorina.
Kas ligaasid nõuavad ATP-d?
Tavaliselt kasutatakse kahte DNA ligaasi. … T4 ligaas vajab ATP , samas kui E. coli ligaas vajab NAD+ (nikotiinamiidadeniindinukleotiid on koensüüm, mis koosneb 2 nt-st, mis on ühendatud nende fosfaatrühmade kaudu). Mõlemad katalüüsivad 5'-fosfaat- ja 3'-OH-rühma liitumist, moodustades fosfodiestersideme.
Miks vajavad ligaasid ATP-d?
DNA ligeerimisreaktsiooni kaks etappi
DNA ligeerimisreaktsioonil endal on kaks põhietappi. Esiteks peavad DNA otsad juhuslikult kokku põrkuma ja jääma koos piisav alt kauaks, et ligaas nendega ühineks. … Et ensüüm saaks läbi viia täiendavaid reaktsioone, tuleb ensüümi aktiivses kohas AMP täiendada ATP-ga.
Mis on ligaaside funktsioon?
DNA ligaasid mängivad olulist rolli genoomilise terviklikkuse säilitamisel, ühendades DNA fosfodiesterkarkassi katkeid, mis tekivad replikatsiooni ja rekombinatsiooni käigus ning DNA kahjustuse ja selle tagajärjel remont. Kolm inimese geeni, LIG1, LIG3 ja LIG4, kodeerivad ATP-sõltuvaid DNA ligaase.
Mis on ligaasid, kas need töötavad aktiivselt või passiivselt?
DNA ligaas on aktiivne DNA replikatsiooni, parandamise ja rekombinatsiooni protsessis. Seda kasutatakse laialdaselt üheahelaliste remonditöödelkatkeb elusorganismide dupleks-DNA-s, kasutades matriitsina topeltheeliksi komplementaarset ahelat, samas kui mõned vormid võivad spetsiifiliselt parandada kaheahelalisi kahjustusi.
